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巧妙新蛋白技术加快新药研制

蛋白质的开发通常从原子结构层面尝试各种组合,由于这些组合几乎是无尽地多,因此开发一种有用的新蛋白是费时费力的工作。现在一些研究者发现,如果用大一些的结构作为基础模块尝试组合,将有效提高开发速度。

主要研究员美国达特茅斯学院(Dartmouth College)的计算机科学助理教授格里高良(Gevorg Grigoryan)说:“你设计一栋大楼,不用了解沙子如何构成砖头,因为你知道石头是什么样子、特性如何,只要把精力放在砖头如何组合成需要的形状。我们采取的是一样的策略,我们聚焦在次结构层面。”

蛋白是很有用的化合物,从帮助消化食物到自然免疫各类药品,都需要蛋白的参与。多年来,由于研制的速度慢,人造蛋白领域还不是很发达,比如胰岛素,大多数还是从天然渠道获得。

科学家以前都聚焦于研究各种氨基酸组合,这要耗费大量时间和物资开支。

这份新研究中,研究者检视了15万种蛋白的三维模型,发现一些数量并不多的经常重复出现的子结构。这让研究者意识到,如果以它们作为基础构建模块,等同于忽略大量不能组成功能性蛋白的组合,这将大幅提升开发新蛋白的速度。

这份研究近期发表在《美国国家科学院院刊》(PNAS)上。

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